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国家动物博物馆是我院战略生物资源的重要保藏地和重要场所的科普场所，拥有亚洲最大的生物标本馆和国内最大的动物标本展示馆。标本馆收藏有各类动物标本760万余号，约占中国科学院生物标本总藏量的1/3；展示馆展陈5000余种上万件动物标本和展品。
中国科学院植物所标本馆（PE）有80多年的建馆历史，建筑面积11,000m2，馆藏标本270万余份。作为亚洲最大的植物标本馆，其是国家战略生物资源重要的保存中心，具有重要国际影响。
昆植标本馆为国内第二大植物标本馆，是我国影响力最大的植物标本馆之一。同时，丰富的馆藏、良好的标本数字化能力，突出的数字平台体系以及优秀的网络科普平台和专注的科普工作，使其成为国内最具特色的植物标本馆。
馆区面积1200㎡，收藏菌物标本超过52万余号，采集自全国及世界111个国家和地区，是我国乃至亚洲收藏量最大的菌物标本馆，为世界各地菌物学者提供良好的科研平台，为我国菌物资源、分布格局及系统演化的澄清提供了重要的研究材料。
华南植物园标本馆创建于1928年，馆藏标本逾100万份，极富华南区域和热带亚热带特色，收藏的东南亚国家标本约占全馆标本的8%。
中国科学院武汉植物园标本馆始建于1956年。1972年初，湖北省政府拨出专项经费建设植物标本馆，1972年12月正式投入使用。在国家财政部专项经费的支持下，2001年4月，本馆开始扩建，同年10月竣工。建筑面积1800平方米，其中标本储藏间751平方米，建有主标本馆、附号标本馆和非洲植物标本馆。标本馆收藏保存了维管植物标本25万余份，已经入柜24万余份。（包括各类模式标本528份；裸子植物标本2100份；被子植物标本21万余份；蕨类植物标本7600份；非洲植物标本21500份）
本馆收集保存标本20万份，主要收集云南热区标本，同时收藏地区性森林群落定位研究凭证标本和种子标本以及植物园引种栽培的植物凭证标本，属于地区性热带植物标本馆，服务植物园物种收集，科学研究及科普教育。
昆明动物博物馆始建于1959年，是国家二级博物馆、国家科普教育基地。昆明动物博物馆是我国西南地区规模最大、收藏量最为丰富的动物专题博物馆，现馆藏涵盖了我国西南各种生态类型的动物标本，具有浓郁的地域特色。
上海昆虫博物馆的前身为1930年创建的震旦博物院，2004年组建集收藏、科普、科研和社会服务为一体的专业博物馆。近年来，随着博物馆的发展壮大，在馆藏标本的增加、科普教育的深入、人才队伍的建设以及对国家和社会的支撑服务等方面都取得长足进步。
水生生物博物馆收藏有40万号标本，包括我国淡水鱼类标本1000余种，30余万号；藻类标本2万多号；以及部分水生无脊椎动物标本。展厅面积1000平方米，展示有珍稀水生动物、长江鱼类和青藏高原鱼类等标本；通过图片、视频和文字等方式，展示了藻类、水生植物、水生无脊椎动物、鲸类等水生生物类群；还展示了部分最新研究成果；设有科普课堂，网上博物馆；开发有手机APP和微信公众号等。
中国科学院海洋生物标本馆隶属于海洋研究所。始建于1950年，是我国规模最大的海洋生物标本馆，海洋生物标本收藏量居亚洲之首（照片1）。标本馆与海洋生物分类与系统演化实验室并存，现有正式职工37人（其中含院士1人、研究员7人，副研究员11人，专职标本管理人员3人），在读研究生19人，聚集了一支分类门类齐整的海洋生物分类与多样性研究团队。