华南植物鉴定中心以中国科学院华南植物园植物科学研究中心和华南植物园标本馆为支撑，作为政府授权的检测机构，为海关、森林公安分局、法院、检察院、林业局、自然保护区、科技和相关政府管理部门的办案、决策和调研等提供服务，为野生植物保护和违法贸易提供快速可靠的物种鉴定服务。同时，也面向全社会的其他研究单位、高校及社会团队提供植物及相关制品提供物种鉴定服务。近年来，针对公安机关、海关边防、林业部门、社会团体和个人等鉴定红木植物原树种的需求，鉴定中心还专设“红木DNA鉴定平台”。

2016年，华南植物鉴定中心为社会提供近90批次物种鉴定，其中一份外来种经鉴定是我国新记录科。